下列说法正确的是：

参考解析：

第一步，本题考查综合分析，选出正确的一项。
第二步A选项，简单计算，定位文字材料“（2017年）我国研究生招生61.1万人，在学研究生179.4万人，毕业生51.4万人，普通本专科在校生2468.1万人，毕业生638.7万人”，专科以上学历包括研究生与普通本专科，应为51.4+638.7=690.1万人，错误。
B选项，简单比较，定位文字材料“（2017年）特殊教育招生6.6万人，在校生36.8万人，毕业生5.1万人。”2017年特殊教育毕业人数为5.1万人应低于招生人数为6.6万人，错误。
C选项，简单计算，定位文字材料“普通本专科在校生2468.1万人，普通高中在校生2435.9万人”，普通高中在校生人数很明显低于其他教育层次在校生人数总和，错误。
D选项，简单计算，定位文字材料“初中招生1496.1万人。普通小学毕业生1581.1万人。”，小学毕业人数为1581.1万人，初中招生1496.1万人，则有1581.1-1496.1=85万人没有入读我国初中学校，正确。
因此，选择D选项。