在人体肠道内，存在着许多菌群，有些是有益菌，有些是有害菌，也有的是中性菌。下列选项中均为有益菌的是：

参考解析：

第一步，本题考查有益菌。
       第二步，有益菌有三种：乳酸菌（活性乳酸菌、嗜酸乳杆菌、植物乳杆菌、保加利亚乳杆菌、德氏乳杆菌）、酵母菌（产阮假丝酵母、啤酒酵母）、芽孢杆菌（枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌）。因此D项均为有益菌。
       因此，选择D选项。
       A项：活性乳酸菌是有益菌，大肠杆菌是中性菌，正常情况下，大多数大肠杆菌是非常安分守己的，他们不但不会给我们的身体健康带来任何危害，反而还能竞争性抵御致病菌的进攻，同时还能帮助合成维生素K2，与人体是互利共生的关系。只有在机体免疫力降低、肠道长期缺乏刺激等特殊情况下，这些平日里的良民才会兴风作浪，移居到肠道以外的地方，例如胆囊、尿道、膀胱、阑尾等地，造成相应部位的感染或全身播散性感染。
       B项：枯草芽孢杆菌是有益菌，肠球菌属肠球菌属，是人类和动物肠道正常菌群的一部分，通常在引起腹腔和盆腔感染所分离的混合菌丝中发现，既往认为肠球菌是对人类无害的共栖菌，但近年研究已证实了肠球菌的致病力。在需氧革兰阳性球菌中，它是仅次于葡萄球菌的重要院内感染致病菌，肠球菌亦可引起院外感染。肠球菌不仅可引起尿路感染、皮肤软组织感染，还可引起危及生命的腹腔感染、败血症、心内膜炎和脑膜炎等。
       C项：绿脓杆菌和产气荚膜杆菌均为有害菌。