关于2013年3月末贷款余额情况，能够从上述资料中推出的是：

参考解析：

第一步，本题考查综合分析问题，且需选择正确的选项。
第二步，A选项，简单计算中的和差类。定位第二段，“2013年3月末，主要金融机构及小型农村金融机构、外资银行人民币小微企业贷款余额11.78万亿元，同比增长13.5%，比全部企业贷款余额增速高1.2个百分点”，直接计算，得全部企业贷款余额同比增长率＝13.5%－1.2%＝12.3%，错误。
B选项，已知现期量与增长率的增长量计算。定位第四段，“2013年3月末，主要金融机构及小型农村金融机构、村镇银行、财务公司本外币农村贷款余额15.24万亿元，同比增长18.4%”，根据公式，增长量＝现期量×增长率/（1+增长率），18.4%≈，根据增长量n＋1计算原则，农村贷款余额比上年同期增长=，即不足3万亿元，错误。
C选项，增长率读数比较。定位最后一段，“2013年3月末，个人购房贷款余额8.57万亿元，同比增长17.4%。保障性住房开发贷款余额6140亿元，同比增长42.4%”，读数可知，个人购房贷款余额同比增速（17.4%）保障性住房开发贷款余额同比增速（42.4%），错误。
D选项，增长量与倍数杂糅。定位第三段，“2013年3月末，主要金融机构本外币工业中长期贷款余额6.46万亿元，同比增长3.2%。服务业中长期贷款余额16.55万亿元，同比增长8.9%”。根据公式，增长量＝现期量×增长率/（1+增长率），8.9%≈，3.2%≈，根据增长量n＋1计算原则，服务业中长期贷款余额比上年同期增长＝、工业中长期贷款余额比上年同期增长＝。则服务业中长期贷款余额同比增量超过工业中长期贷款余额的倍数＝，故服务业中长期贷款余额同比增量超过工业中长期贷款余额的3倍，正确。
因此，选择D选项。