下列命题中，包含辩证法思想的有：

参考解析：

第一步，本题考查唯物辩证法知识。
第二步，中国传统哲学中包含有丰富的辩证法思想。题中所给出的四个选项都是中国古代典型的辩证法观点。
A项：“天地变化，二端而已”出自宋代张载《正蒙·太和》。原句：无无阴阳者，以是知天地变化，二端而已。讲的是阴阳两体，天地间的一切变化，无非是阴阳二端发生交感的作用，体现了矛盾双方对立统一的辩证法思想。
B项：“自动自休，自峙自流”出自唐代柳宗元《非国语·山川震》。原句：自动自休，自峙自流，是恶乎与我谋？意思是说它们（山川）自己运行，自己休止，自己屹立，自己流动，这哪里是与人商量过的呢？是说事物的变化是由内因所决定的。唯物辩证法认为事物的内部矛盾（即内因）是事物自身运动的源泉和动力，是事物发展的根本原因。外部矛盾（即外因）是事物发展、变化的第二位的原因。内因是变化的根据，外因是变化的条件，外因通过内因而起作用。，包含了辩证法的思想。
C项：“吁言吹冷，交错而动”出自唐代柳宗元《天对》。原句：合焉者三，一以统同。吁炎吹冷，交错而功。意思是阴、阳、天统一而为元气。运动是元气本身对立“交错”的作用，世界万物的运动变化是元气自身的阴阳二气相互作用的结果，阴阳二气之外并不存在其他神秘的动力。体现了事物的两面性及其辩证统一的哲学思想。包含了辩证法的思想。
D项：“万物莫不有对”是指万事万物都有与之相对的一面，即矛盾具有普遍性，要求我们用全面的观点，一分为二地看问题。包含了辩证法的思想。
因此，选择ABCD选项。