2021年10月16日出发，到2022年4月16日安全着陆，“太空出差”三人组在中国空间站度过了6个月的时间。4月16日9时56分，神州十三号载人飞船返回舱缓缓降落在东风着陆场。A点为晨昏线与纬线相切的切点，当神州十三号降落时，A点此时盛行东南风。“太空出差”三人组在中国空间站期间，A点的移动方向为：

参考解析：

第一步，本题考查自然地理知识。
第二步，题干中，A点为晨昏线与纬线相切的切点，即A点在晨昏圈的最北端或最南端。晨昏圈的最北端位于北极圈以北，盛行东北风（极地东风+向右偏转）；最南端位于南极圈以南，盛行东南风（极地东风+向左偏转）。已知A点此时盛行东南风，所以A点在南极圈以南。“太空出差”三人组在中国空间站期间，是2021年的10月16日至2022年的4月16日。
①2021年10月16日至12月21日，太阳直射点从6°S往南回归线（23°26′S）移动。再加上通过切点的纬度数与太阳直射点的纬度数互余，也就是切点的纬度数从84°S向66°74′S移动，即往北移动。
②2021年12月21日至2022年3月20日，太阳直射点从南回归线（23°26′S）往赤道（0°）移动。再加上通过切点的纬度数与太阳直射点的纬度数互余，也就是切点的纬度数从66°74′S向90°S移动，即往南移动。
③2022年3月20日至2022年4月16日，太阳直射点从6°N向北回归线（23°26′N）移动，再加上通过切点的纬度数与太阳直射点的纬度数互余，也就是切点的纬度数从90°S向66°74′S移动，即往北移动。
所以，“太空出差”三人组在中国空间站期间，A点的移动方向为：先往北再往南再往北。
因此，选择D选项。