关于S地区航空运输业运行状况，能够从上述资料中推出的是：

参考解析：

第一步，本题考查综合分析问题，且需选出正确的一项。
A选项，混合增长率。定位文字材料第一段，“2019年上半年，S地区航空运输旅客吞吐量累计完成1773.9万人次，同比增长11.5%……其中1季度旅客吞吐量累计完成841.9万人，同比增长10.2%”，上半年=1季度＋2季度，根据混合增长率口诀，整体增速介于各部分增速之间，且偏向于基期量较大一方，1季度（10.2%）＜上半年（11.5%）＜2季度，可知2季度增速高于1季度，正确。
B选项，增长量计算。定位文字材料第三段，“2019年6月，飞行起降41804架次，同比增长13.2%”，12.5%＜13.2%＜14.3%，则13.2%≈，根据增长量计算n＋1原则，代入数据可得，直除首位商4，同比增加不到6000架次，错误。
C选项，现期平均数比较。定位文字材料第一段和第三段，“2019年上半年，S地区航空运输旅客吞吐量累计完成1773.9万人次”“2019年6月，S地区航空运输旅客吞吐量完成321.3万人次”，要使6月＜，即6×6月＜1—6月，321.3×6＞1773.9，6月高于1—5月平均水平，错误。
D选项，现期倍数计算。定位文字材料第二段，“2019年上半年，S地区累计完成通用航空飞行19999小时……其中1季度累计完成通用航空飞行4564.3小时”，要使2季度＞1季度×4，1季度＋2季度＞1季度×5，即上半年＞1季度×5即可，19999＜4564.3×5，错误。
因此，选择A选项。