嗜酸菌能够将硫化物或硫氧化成硫酸，硫酸即可将矿石中的铁、铜、钴、镍、锌、锡、铀等金属溶解提取出来，进行回收。嗜酸菌的这一“冶金”特性对贫矿和多组分矿的综合利用做出了贡献。同理，嗜酸菌还可以处理重金属污染的土壤，铜、锌、镍、镉去除率可达80%以上，成本比传统的酸处理法低得多。
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