浦东“十三五”时期的成就包括：

参考解析：

ABCD
第一步，本题考查时政。
第二步，“十三五”时期，浦东已基本建成具有全球影响力的科技创新中心核心承载区框架。量子计算机原型机“九章”等重大成果涌现，C919大型客机等科技赋能产业创新效果明显。此外，浦东率先在全国试点药品上市许可持有人制度等，也体现了体制机制改革方面的示范引领作用。A、B、C、D选项均正确。
因此，选择ABCD选项。
A项：“十三五”期间浦东新区基本建成科创中心核心承载区框架，构建了国家实验室等高端科创资源引领的“金字塔型”创新格局。
B项：“九章”是中国科学技术大学潘建伟团队与中科院上海微系统所、国家并行计算机工程技术研究中心合作研制的量子计算原型机。2020年12月4日，中国科学技术大学宣布该校潘建伟等人成功构建76个光子的量子计算原型机“九章”。
C项：我国首次自主研制的C919客机是由位于上海的中国商用飞机有限责任公司研发。2017年4月18日，C919客机通过首飞放飞评审。4月23日，C919客机完成高速滑行抬前轮试验。5月5日C919在上海浦东机场圆满首飞。11月10日，C919飞机101架机成功从上海转场西安阎良，正式开展后续试飞取证试验工作。
D项：药品上市许可持有人制度与现行药品注册许可制度的最大区别不仅在于获得药品批准文件的主体由药品生产企业扩大到了药品研发机构、科研人员，而且对药品质量自始至终负责的主体也更为明确，从而有利于确保和提升药品质量。2017年，全国首创的医疗器械注册人实施方案在上海自贸区率先进入试点。