在我国近现代学制改革中，第一次规定男女同校，废除读经，充实了自然科学的内容，并将学堂改为学校的学制是（ ）。

参考解析：

本题考查壬子癸丑学制的内容。1912—1913年，南京临时政府颁布了“壬子癸丑学制”，第一次规定男女同校，废除读经，充实了自然科学的内容，并将学堂改为学校。A选项   ，1902年，我国正式颁布第一个现代学制“壬寅学制”，该学制以日本学制为蓝本，只颁布而没有实行。C选项，1904年，清政府颁布并推行了“癸卯学制”，该学制主要继承了日本的学制，是中国实行的第一个现代学制。该学制明文规定教育目的是“忠君、尊孔、尚公、尚武、尚实”，明显反映了“中学为体， 西学为用”的思想。另外，还规定不许男女同校，轻视女子教育，体现了半封建半殖民地社会的特点。D选项，1922年，在北洋军阀统治下，留美派主持的全国教育联合会以美国学制为蓝本，颁布了“壬戌学制”，又称新学制或六三三学制，即小学六年，初中三年，高中三年。该学制明确以学龄儿童和青少年身心发展规律作为划分学校教育阶段的依据，这在我国现代学制史上是第一次。此后，国民党政府于1928年就学制作了些修改，但基本上继承了“壬戌学制”，并一直沿用到全国解放初期。故本题选D。