但是，与此同时，也有一些官员表示，政府开微博，尤其是官员开微博，难度却比想象的要大一些。
2011年11月16日，甘肃省庆阳市正宁县榆林子小博士幼儿园一辆运送幼儿的小客车(核载9人、实载64人)，由西向东行驶至一组砖厂门前路段时，与由东向西行驶的重型自卸货车发生正面相撞，造成21人死亡(其中幼儿19人)，43人受伤。据初步调查，原因是小客车严重超员，在大雾天气下逆向超速行驶，导致事故发生。官员A在微博开通的第二天，对车祸表示很痛心。没想到有网友却在回复中将之抨击成“不作为”，甚至指责她“作秀”。这让她觉得说不出的委屈。有一些官员，因此得了“微博恐惧症”，不敢随便开通微博。
官员B是开通官员微博的典范之一。在开通微博以后，B每天一上班，第一件事情，就是看微博留言，并将有用微博留言作批示，并转交相关部门按时处理。经过“筛查”，从网络上脱身而来，再在行政体制内解决一些问题，然后，再反馈到网络上。B在网络和现实政治生活中“有效”切换，从而实现网络问政。他的这种及时跟进、及时反馈的行为受到群众的好评，其微博的关注度也直线飙升。可是，随之而来的是，面对海量的信息留言，B也愈发的感觉到力不从心。
对此，专业人士分析：“那么多微博，每个微博上都有不同的问政信息，信息没有有效收集、汇总和分析，就容易流于琐碎，难以归纳市民的关注热点和细分的需求”。该人士认为，网络发言人平台以及其他渠道也有相当多的问政信息，虽然有机制保障问政效率及效果，但各平台之间不实现共通，容易造成资源浪费和低效利用。
官员C说：“掌握国家机密的公职人员，有可能不自觉地谈论本职秘密。为此，有必要规定：现役军警人员、涉密机关人员、党和国家高级干部，不得开私人微博。”
5.作为新的资讯平台，个人微博以及对于政府微博的评论本身缺乏权威性，如果利用不当很容易变成谣言的温床。另外，“脏”的问题也影响微博正面作用的发挥，有人说微博已沦为“骂场”，语言暴力借助微博已呈泛滥之势，虽说这种观点以偏概全，但以此为代表的微博负面作用不容小视。
网络水军也已是网路问政的一大问题。全国政协十一届四次会议新闻发言人赵启2日给 “网络水军”画了个像：有些人隐身于普通网民中间，发帖留言，其背后有机构利益。他制造假民意，目的是左右舆论，误导受众，甚至影响政府决策，值得注意与警惕。王元成代表举例说，“网络公关公司组织‘水军’为参选人刷票”，“网络推手煽动公众舆论干扰司法案件、左右案件调查和审判”等情况越来越多，有些事件甚至误导了政府的相关决策。 翟惠生委员说，“网络水军”制造的虚假信息在很大程度上混淆视听，对广大网民的诱导力很强，不仅给政府通过网络集纳民意带来麻烦，影响政策决策的执行力、贯彻力，而且容易造成网民的认知错位和对政策的抵触，以致影响社会心态和社会情绪，而这两者恰恰是社会稳定的基础。
网络问政还隐含着来自国外的危险。例如2009年的伊朗大选，一些西方国家的媒体和政治势力就借助于Twitter大肆散布谣言，宣扬总统竞选存在严重舞弊行为等未经证实的小道消息，引发伊朗政治骚乱。这次政治危机被《时代》周刊称为“Twitter革命”。
6.2011年4月22日，复旦大学“舆情与传播研究实验室”发布了我国第一份《中国政务微博研究报告》。统计显示，截至2011年3月20日，中国目前已有2400余个政务微博，全国范围内共有实名认证的政务机构微博1708个，政府官员微博720个，覆盖中国大陆所有省级行政区域，“微博问政”已渐成政府信息公开新趋势。政务微博在全国范围内呈现出蓬勃发展之势，推动着政务发展进入智能化时代。
上海政务微博建设的意识比较强，机构、官员与本市网民互动程度较高。据统计，截止 2011年3月20日，上海市共有实名认证的政务机构微博账号4个，政府官员微博账号140 个。新民网“上海滩微博”开设“政务互动”专栏，首页强调“上海政务互动平台——人民智慧最给力”，列出较为完整的上海市政府机关及官员微博列表。此外，专设“政府发布”、“我想对政府机构(官员)说”、“政府回应”等页面发布栏，适时统计更新政府机构、官员微博发布情况以及网友回复情况。2011 年上海两会期间，微博作为人大代表与市民的网络互动平台，展现了良好的沟通效果。如人大代表裴蓁，在两会期间在上海滩微博建立“微圈”与网友互动，甚至为其排忧解难，吸引了众多粉丝，具有较大的影响力。另一位人大代表“柏阿姨”柏万青，担任的微博调解员角色也被网民广泛关注。
